L'addestramento nella Bujinkan è comunemente denominato Taijutsu (体術) è un termine che fa riferimento alle tecniche che si basano sui movimenti del corpo. Si compone di tecniche "a mani nude" o uso delle armi.

Gran parte del Taijutsu di base proviene da sei delle nove ryūha ovvero: Kotō-ryū, Gyokko-ryū, Shinden Fudō-ryū, Takagi Yōshin-ryū, Kuki Shinden-ryū e Togakure-ryū.

Tra le armi utilizzate troviamo le spade (tra le quali Daito, Wakizashi, Tanto, Shinai di bambù, Bokken, etc.), bastoni di varie lunghezze (Bō, Jō, Hanbō, Hanjo/Hanjō), corda, Kusari (catena), Kusarigama (falce con catena), Yari, Kamayari, Bisento (simile a Naginata), Kyoketsu shoge, Jutte, Tessen, Naginata, Kunai, Shuriken di varie forme compreso Boshuriken e Senban Shuriken.

Le grandi potenzialità di questo stile sono state ampiamente testato nei campi di battaglia del periodo feudale giapponese. La grande tecnica che costituisce questo metodo anche se con grandi antiche radici si è evoluto nel tempo costituendo un metodo di difesa personale di grande livello.

La flessibilità dei suoi movimenti e la grande varietà di tecniche sono il vero successo di un metodo che si adatta a qualsiasi praticante riuscendo ad essere punto di riferimento di molti corpi militari che lo adottano come addestramento operativo.

(dal sito www.bujinkan.it)

Le scuole sono: 

- Togakure Ryu Ninjutsu, fondata nel XII secolo. Il suo insegnamento principale è che la violenza deve essere evitata. 

- Kumogakure Ryu Ninjutsu, fondata nel XVI secolo, si caratterizza per i salti nel combattimento e l’uso di colpi e doppie parate.

- Gyokushin Ryu Ninjutsu, utilizza proiezioni e si concentra sull’aspetto strategico e tattico.

- Gyokko Ryu Kosshijutsu, fondata nel secolo XII, si caratterizza per l’uso di lunghe distanze, lussazioni, proiezioni e colpi ai muscoli.

- Koto Ryu Koppojutsu, fondata nel secolo XVI, utilizza la corta distanza. Metodo diretto e corto per colpire le articolazioni.

- Takagi Yoshin Ryu Jutaijutsu, fondata nel secolo XVII, utilizza tecniche di lussazione, proiezione, controlli, strangolamenti e colpi ai punti vitali.

- Shinden Fudo Ryu Dakentaijutsu, fondata nel secolo XII. Una delle caratteristiche di questa scuola è il riconoscimento della Naturalezza come forma difensiva.

- Kukishinden Ryu Happo Hikenjutsu, fondata nel XII secolo. Si caratterizza per l’uso dell’armatura e lo studio di diverse armi tradizionali come i bastoni, spade, lance, ecc…

- Gikan Ryu Koppojutsu, fondata nel secolo XVI. Si caratterizza per l’uso di calci, attacchi di pugno e proiezioni.